市场上用量最大的三醛胶因为含有甲醛等物质而使其具有较强的防腐能力，因此防腐问题不突出。
然而绿色环保型的胶黏剂以天然高分子聚合物如淀粉和蛋白为主要生产原料。其营养丰富，很容易受到多种微生物的侵袭，从而导致胶黏剂腐败变质。其中尤以蛋白基木材胶黏剂及淀粉基木材胶黏剂防腐能力最差，除了部分采用改性的方法得到改善外。多半还是必须借助于添加有效的防腐剂。
天然高分子基的木材胶黏剂防腐与木材防腐的区别在于，木材中养分相对贫乏，主要防腐对象为真菌，防腐方法多以阻断营养供应的方法来实现。天然高分子基木材胶黏剂与食品类一样营养丰富，采用阻断营养供应的方法抑制杂菌不可行，更多的应采用干扰和破坏微生物细胞相关的生理、生化反应和代谢活动的机制：①作用于细胞壁和细胞膜系统；②作用于遗传物质和遗传微粒结构；③作用于酶或功能蛋白。
防腐剂实质上是使微生物细胞相关的生理、生化反应和代谢活动受到干扰和破坏，最终导致微生物死亡或繁殖被抑制。破坏菌体的结构和影响代谢作用及生理活动，使细菌无法生存与繁衍。宁正祥等在研究抗菌作用时。发现防腐剂主要是抑制微生物的呼吸作用。导致能量物质ATP和还原力NADH亏缺，所有的合成代谢受阻。活性的动态膜结构不能维持，代谢方向趋于水解，最后产生细胞自溶。该作者还提出了防腐剂的化学结构与电子运动状态与抗菌性能的关系。具有较高的参考价值。
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